این دیتابیس یک منبع گسترده بیوانفورماتیکی است که برای دسترسی به اطلاعات ژنتیکی طیف وسیعی از گونه‌ها طراحی شده که زیر نظر موسسه بیوانفورماتیک اروپا(EBI) و موسسه ولکام سنگر است.
اهداف و خصوصیات این دیتابیس:
Genome Annotation:
تفسیر جامعی از ژنوم شامل ژن‌ها، رونوشت‌ها، پروتئین‌ها و
عناصر تنظیمی را در اختیار کاربران قرار میدهد. همچنین گونه‌هایی شامل مهره‌داران، ارگانسیم‌های مدل و
هر ارگانیسمی که به مطالعات زیستی مربوط باشد را در اختیار دارد.
Comparative Genomics:
شامل
مقایسه ژنومی (genomic alignment)،
روابط ژنی در بین
گونه‌ها( orthology)
و مقایسه جفت ژنوم برای تسهیل مطالعات تکاملی است.
Integration of Data:
این دیتابیس مجموعه‌ای از دیتاست‌ها نظیر پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی(SNP)، دیتای
توالی یابی RNA و پروب‌های میکرواری را برای نگاشت کردن روی خصوصیات ژنومی با یکدیگر ادغام می‌کند.
Visualization Tools:
کاربران با استفاده از این دیتابیس قادرند از دید گرافیکی و یا جدولی به اطلاعات ژنومی نگاه کنند تا دید عمیق تر و واضح‌تری پیدا کنند.
نحوه دسترسی به این دیتابیس:
وبسایت دیتابیس
سرور APIs:
سرور Perl API:
یک دسترسی برنامه ریزی شده به خصوصیات ژنومی مانند ژن‌ها و SNPs
سرور REST API:
یک جایگزین ساده تر برای استعلام داده‌ها به صورت برنامه‌ای
سرور BioMart:
یک ابزار استخراج داده برای بازیابی مجموعه داده‌های بزرگ با استفاده از پرسش‌های پیچیده.
سرور FTP:
دانلود انبوه پایگاه‌های MySQL و سایر مجموعه داده‌ها را در فرمت‌های استاندارد مانند FASTA ارائه میدهد.
نرم افزارهاEnsembl Project) · GitHub)
