ژورنال هفتگی Rayazist Spotlight با جدیدترین نوآوری‌ها و دستاوردهای بیوانفورماتیک آشنا شوید:   هوش مصنوعی این بار دست به طراحی آنزیم می زند!     طی سالیان اخیر هوش مصنوعی کاربردهای گستره ای در تحقیقات زیستی و مهندسی ایجاد کرده است؛ حوزه زیست پزشکی نیز از این قائده مستثنی نبوده است. یکی از کاربردهای آن در حیطه پزشکی و داروسازی است.   آنزیم ها پروتئین هایی هستند که نقش کاتالیزوری در …

ادامه مطلب

نقش تحول آفرین یادگیری ماشین در تشخیص و درمان اندومتریوز اندومتریوز (EMS) یک بیماری التهابی مزمن وابسته به استروژن است که به شدت بر کیفیت زندگی و سلامت باروری میلیون‌ها زن در سراسر جهان تأثیر می.گذارد با وجود شیوع بالا، تشخیص و درمان اندومتریوز همچنان یک چالش بزرگ است زیرا این بیماری دارای پاتوفیزیولوژی پیچیده ای است و روشهای غیرتهاجمی قابل اعتمادی برای تشخیص آن وجود ندارد اما با ظهور …

ادامه مطلب

 پیری تخمدان یکی از چالش‌های مهم در پزشکی تولیدمثل است که تأثیر گسترده‌ای بر سلامت زنان دارد. برخلاف بسیاری از ارگان‌های دیگر، تخمدان‌ها زودتر وارد روند پیری می‌شوند و این امر با کاهش تعداد فولیکول‌ها، کاهش سطح استروژن و افزایش خطر بیماری‌های مرتبط همراه است. اما چرا هنوز درمان‌های مؤثری برای کند کردن این روند نداریم؟ پاسخ در پیچیدگی مکانیسم‌های این فرآیند نهفته است.    بیوانفورماتیک، در کنار فناوری‌های نوظهور …

ادامه مطلب

آشنایی با پایگاه‌‌های داده بیوانفورماتیکی و کاربردهای آن‌ها    پایگاه‌های داده بیوانفورماتیکی ابزارهای کلیدی برای ذخیره و تحلیل داده‌های زیستی هستند و در زمینه‌های مختلفی مانند ژنومیکس، پروتئومیکس و کشف دارو کاربرد دارند. در اینجا به برخی از مهم‌ترین دیتابیس‌ها و کاربردهای آن‌ها اشاره می‌کنیم:      پایگاه‌های داده ژنومیکس و توالی‌یابی    پایگاه داده NCBI GenBank   پایگاه داده Ensembl   پایگاه داده UCSC Genome Browser    پایگاه‌های داده بیان ژنی …

ادامه مطلب

ترنسکریپتومیکس فضایی به ما کمک می‌کند تا بفهمیم چگونه ژن‌ها در بافت‌های مختلف بدن بیان می‌شوند. با پیشرفت این فناوری، داده‌های بیشتری در دسترس داریم که به ما امکان می‌دهد تا بهتر بفهمیم سلول‌ها چگونه تصمیم می‌گیرند و در بیماری‌ها چه نقشی دارند.     وانگ و همکارانش مدل scGPT-spatial را معرفی کرده‌اند که بر اساس مدل قبلی scGPT ساخته شده است و برای داده‌های خاص ترنسکریپتومیکس فضایی آموزش دیده است. …

ادامه مطلب

  دومین کارگاه عملی از  مجموعه کارگاه‌های آموزشی In silico بر پایه AI، با نظارت سرکار خانم دکتر فاطمه ابراهیمی طی 4 جلسه برگزار و به پایان رسید.   در این دوره، شرکت‌کنندگان به‌طور عملی با اصول برنامه‌نویسی پایتون و کاربردهای آن در حوزه هوش مصنوعی آشنا شدند و با انجام یک پروژه کوچک، یادگیری خود را تثبیت کردند.  و به منظور ارتقاء دانش شرکت‌کنندگان، مجموعه‌ای از ویدئوهای آموزشی سرکار خانم …

ادامه مطلب

     روش‌های مولکولی و مدل‌سازی در کشف دارو، به مجموعه‌ای از تکنیک‌ها و رویکردها اشاره دارند که به پژوهشگران کمک می‌کنند تا مولکول‌های جدید دارویی را شناسایی، طراحی و بهینه‌سازی کنند. این روش‌ها معمولاً شامل ترکیبی از بیوانفورماتیک، شبیه‌سازی‌های کامپیوتری و تکنیک‌های آزمایشگاهی هستند.   روش‌های مولکولی   اسکن دارویی (High-throughput screening):  این روش شامل آزمایش هزاران ترکیب شیمیایی برای شناسایی مولکول‌هایی است که می‌توانند با هدف بیولوژیکی خاصی …

ادامه مطلب

   در تاریخ 16 الی 18 بهمن ماه، شهر زنجان میزبان جمعی از اساتید و پژوهشگران علاقه‌مند به حوزه زیست‌شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک بود.     در این کنگره، شرکت‌کنندگان با بازدید از میز رایازیست‌آزما، از نزدیک با فعالیت‌های ما آشنا شدند و زمینه‌های همکاری‌های آینده را بررسی کردند.   پژوهشگران رایازیست‌آزما نیز با ارائه پوسترهای حضوری در حوزه‌های متنوع بالینی و محاسباتی از جمله داکینگ، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی، زیست‌شناسی سامانه‌ای، …

ادامه مطلب

پایان روز اول سیزدهمین همایش ملی بیوانفورماتیک ایران    دیدار و گفتگو با شما عزیزان فرصتی بسیار عالی و فوق‌العاده برای ما بود.     امیدواریم در آینده با شمار بیشتری از شما همراهان گرامی ملاقات داشته باشیم.     به امید دیدار مجدد شما  

ادامه مطلب

دومین کارگاه از دوره جامع آموزش‌های In Silico بر پایه AI در حال برگزاری است!  در روز گذشته جلسه اول کارگاه عملی پایتون در تحلیل‌های In Silico با تدریس سرکار خانم دکتر فاطمه ابراهیمی برگزار شد و شرکت‌کنندگان با مبانی برنامه‌نویسی پایتون و کاربردهای آن در هوش مصنوعی آشنا شدند. این کارگاه فرصتی بی‌نظیر برای یادگیری روش‌های نوین تحلیل داده‌ها در زیست‌شناسی محاسباتی است. چرا باید به این دوره بپیوندید؟ آموزش …

ادامه مطلب