پکیج آموزشی مدل‌سازی بر پایه ریاضیات

پکیج آموزشی مدل‌سازی بر پایه ریاضیات
اگر می‌خواهید دنیای مدل‌سازی، ماشین لرنینگ (Machine Learning) و دیپ لرنینگ (Deep Learning) را عمیق‌تر درک کنید، این پکیج دقیقاً برای شما طراحی شده است. در این دوره، تمام مفاهیم ریاضی مورد نیاز برای ساخت و درک مدل‌ها، از پایه تا سطح پیشرفته، به‌صورت کاربردی آموزش داده می‌شود.   در این پکیج چه یاد می‌گیرید؟ مبانی جبر خطی، آمار و احتمال و مبانی گراف مفاهیم ریاضی پشت الگوریتم‌های یادگیری ماشین …
ادامه مطلب

کارگاه با همخوانی کتاب طراحی دارو به همراه انجام پروژه

کارگاه با همخوانی کتاب طراحی دارو به همراه انجام پروژه
فقط یادگیری تئوری؟ نه! این کارگاه برای چه رشته هایی مناسبه؟ جهت کسب اطلاعات بیشتر درباره این کارگاه با ادمین در تلگرام در ارتباط باشید @zeinabshams73      
ادامه مطلب

زیست شناسی محاسباتی، جایگزین حیوانات آزمایشگاهی

زیست شناسی محاسباتی، جایگزین حیوانات آزمایشگاهی
دنیای زیست‌پژوهی در حال تغییر است... امروز دیگر برای درک بیماری‌ها یا طراحی دارو، نیازی به حیوانات آزمایشگاهی نیست. روش‌های In silico با ترکیبی از مدل‌سازی ریاضی، شبیه‌سازی مولکولی و یادگیری ماشین، دنیایی نو در پژوهش‌های زیستی ساخته‌اند — دنیایی که در آن، می‌توان رفتار سلول، ژن یا دارو را در رایانه بازسازی کرد؛ سریع‌تر، دقیق‌تر، و بدون رنج هیچ موجود زنده‌ای. در سمینار ملی روش‌های جایگزین حیوانات آزمایشگاهی درباره‌ی …
ادامه مطلب

چرا وقتی صحبت از گراف میشه، پای ماتریس هم وسط میاد؟

چرا وقتی صحبت از گراف میشه، پای ماتریس هم وسط میاد؟
  واقعیت اینه که یکی از بهترین روش‌های نمایش گراف، ماتریس مجاورت (Adjacency Matrix) هست. تو این روش هر راس می‌شه یه سطر و ستون، اگه بین دو راس ارتباط باشه عدد ۱ می‌ذاریم و اگه نباشه ۰. همین ماتریس ساده کلی اطلاعات مهم به ما می‌ده: درجه هر راس رو می‌تونیم از جمع سطر یا ستون به دست بیاریم، تعداد مسیرها رو با توان‌های مختلف ماتریس حساب کنیم و …
ادامه مطلب

چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟

 چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟
وقتی اسم گراف میاد، خیلی‌ها یاد یک مفهوم در علم ریاضی می‌افتن!  اما واقعیت اینه که دنیای زیست‌شناسی پر از شبکه‌هاست، و گراف بهترین زبون برای خوندن این شبکه‌هاست.     گراف یعنی مجموعه‌ای از نقطه‌ها (راس‌ها) و خط‌ها (یال‌ها) که نشون می‌ده کی به کی وصله. حالا بذار ببینیم تو زیست چه جوریه: شبکه پروتئین‌ها (PPI): پروتئین‌ها تنها کار نمی‌کنن؛ دست به دست هم می‌دن. هر پروتئین یه راسه …
ادامه مطلب

اگر هر دارو یک شناسنامه داشت...

اگر هر دارو یک شناسنامه داشت...
همون‌طور که ما آدما شناسنامه داریم (اسم، سن، قد و …)، داروها هم می‌تونن یک شناسنامه عددی داشته باشن.     این شناسنامه در علم به اسم ماتریس ویژگی داروها (Feature Matrix) شناخته می‌شه. مثلاً: دارو A → وزن مولکولی 300، محلول در آب، ۲ پیوند هیدروژنی دارو B → وزن مولکولی 450، چربی‌دوست، ۵ پیوند هیدروژنی وقتی صدها یا هزاران دارو رو کنار هم بذاریم، یک جدول بزرگ تشکیل …
ادامه مطلب

ماتریس ویژگی داروها؛ شناسنامه عددی مولکول‌ها

ماتریس ویژگی داروها؛ شناسنامه عددی مولکول‌ها
هر دارو یا مولکول یک ساختار پیچیده شیمیایی دارد، اما برای اینکه رایانه‌ها بتوانند آن را تحلیل کنند، باید این ساختار به زبان اعداد ترجمه شود. اینجاست که ماتریس ویژگی داروها (Feature Matrix) وارد عمل می‌شود.     در این ماتریس، هر دارو به صورت یک ردیف و هر ویژگی (Feature) به صورت یک ستون نمایش داده می‌شود: ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی: وزن مولکولی، LogP، بار الکتریکی… ویژگی‌های ساختاری: تعداد حلقه‌های آروماتیک، …
ادامه مطلب

ماتریس‌ها؛ زبان پنهان طراحی دارو

ماتریس‌ها؛ زبان پنهان طراحی دارو
شاید وقتی اسم ماتریس میاد یاد کلاس ریاضی بیفتید، اما همین ماتریس‌ها قلب تپنده خیلی از پیشرفت‌های امروزی در طراحی دارو هستن. ماتریس‌ها به ما اجازه می‌دن: خواص شیمیایی هزاران مولکول رو در یک جدول منظم ذخیره کنیم. برهم‌کنش داروها با پروتئین‌ها رو در قالب یک Drug–Target Matrix نشون بدیم. شبکه‌های زیستی مثل ارتباط ژن‌ها و پروتئین‌ها رو مدل کنیم. حرکت هزاران اتم رو در شبیه‌سازی دینامیک مولکولی دنبال کنیم. …
ادامه مطلب

جستجو در مقالات

سبد خرید