چرا وقتی صحبت از گراف میشه، پای ماتریس هم وسط میاد؟

۰۲ مهر ۰۴ مطالب آموزشی هوش مصنوعی ، بیوانفورماتیک ، bioinformatics ، Neural Networks ، matrix ، ماتریس ، algebra ، جبر ، گراف ، Graph ، شبکه عصبی
چرا وقتی صحبت از گراف میشه، پای ماتریس هم وسط میاد؟
  واقعیت اینه که یکی از بهترین روش‌های نمایش گراف، ماتریس مجاورت (Adjacency Matrix) هست. تو این روش هر راس می‌شه یه سطر و ستون، اگه بین دو راس ارتباط باشه عدد ۱ می‌ذاریم و اگه نباشه ۰. همین ماتریس ساده کلی اطلاعات مهم به ما می‌ده: درجه هر راس رو می‌تونیم از جمع سطر یا ستون به دست بیاریم، تعداد مسیرها رو با توان‌های مختلف ماتریس حساب کنیم و …
ادامه مطلب

چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟

۰۲ مهر ۰۴ مطالب آموزشی بیوانفورماتیک ، زیست شناسی محاسباتی ، زیست شناسی ، bioinformatics ، computational biology ، biology ، گراف ، شبکه ، Graph ، network
چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟
وقتی اسم گراف میاد، خیلی‌ها یاد یک مفهوم در علم ریاضی می‌افتن!  اما واقعیت اینه که دنیای زیست‌شناسی پر از شبکه‌هاست، و گراف بهترین زبون برای خوندن این شبکه‌هاست.     گراف یعنی مجموعه‌ای از نقطه‌ها (راس‌ها) و خط‌ها (یال‌ها) که نشون می‌ده کی به کی وصله. حالا بذار ببینیم تو زیست چه جوریه: شبکه پروتئین‌ها (PPI): پروتئین‌ها تنها کار نمی‌کنن؛ دست به دست هم می‌دن. هر پروتئین یه راسه …
ادامه مطلب

ماتریس ویژگی داروها؛ شناسنامه عددی مولکول‌ها

۲۱ شهریور ۰۴ مطالب آموزشی هوش مصنوعی ، بیوانفورماتیک ، رایا زیست آزما ، برنامه نویسی ، RayaZistAzma ، bioinformatics ، یادگیری ماشین ، machine learning ، طراحی دارو ، drug design
ماتریس ویژگی داروها؛ شناسنامه عددی مولکول‌ها
هر دارو یا مولکول یک ساختار پیچیده شیمیایی دارد، اما برای اینکه رایانه‌ها بتوانند آن را تحلیل کنند، باید این ساختار به زبان اعداد ترجمه شود. اینجاست که ماتریس ویژگی داروها (Feature Matrix) وارد عمل می‌شود.     در این ماتریس، هر دارو به صورت یک ردیف و هر ویژگی (Feature) به صورت یک ستون نمایش داده می‌شود: ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی: وزن مولکولی، LogP، بار الکتریکی… ویژگی‌های ساختاری: تعداد حلقه‌های آروماتیک، …
ادامه مطلب

نمایش روابط در سیستم‌های زیستی با ماتریس

۱۵ شهریور ۰۴ مطالب آموزشی بیوانفورماتیک ، زیست شناسی محاسباتی ، جبر خطی ، bioinformatics ، matrix ، ماتریس ، algebra
نمایش روابط در سیستم‌های زیستی با ماتریس
در سیستم‌های زیستی، اجزایی مثل ژن‌ها، پروتئین‌ها یا متابولیت‌ها با یکدیگر ارتباط دارند. این ارتباط می‌تواند به صورت فعال‌سازی، مهار کردن یا بی‌اثر بودن باشد. برای ذخیره این روابط به شکلی که بتوانیم آن را محاسبه کنیم، از چیزی به نام ماتریس مجاورت استفاده می‌کنیم. در این ماتریس، هر سطر نشان می‌دهد یک جزء روی کدام اجزای دیگر اثر می‌گذارد و هر ستون نشان می‌دهد یک جزء از کدام اجزای …
ادامه مطلب

مدل‌های ریاضی در یادگیری ماشین

۲۴ مرداد ۰۴ مطالب آموزشی هوش مصنوعی ، بیوانفورماتیک ، ریاضی ، AI ، bioinformatics ، computational biology ، مدلسازی ریاضی ، machine learning ، ai
مدل‌های ریاضی در یادگیری ماشین
حالا که فهمیدیم مدل‌سازی ریاضی چقدر مهمه، بیاید چند مدل معروف و ساده رو با هم مرور کنیم:   رگرسیون خطی (Linear Regression) یه مدل خیلی ساده که رابطه‌ی بین ورودی‌ها و خروجی‌ها رو با یه خط یا صفحه توصیف می‌کنه. درخت تصمیم (Decision Tree) یه مدل شبیه یک نمودار شاخه‌دار که سوال‌های ساده می‌پرسه و بر اساس جواب‌ها مسیر رو انتخاب می‌کنه تا به نتیجه برسه. ماشین بردار پشتیبان …
ادامه مطلب

کارگاه مدل‌سازی ریاضی در مطالعات زیست‌مولکولی، جایی که ریاضیات به کشف رازهای سرطان کمک می‌کند.

۱۹ مرداد ۰۴ مطالب آموزشی ، رویدادها بیوانفورماتیک ، رایا زیست آزما ، زیست شناسی محاسباتی ، ریاضی ، زیست شناسی ، برنامه نویسی ، bioinformatics ، computational biology ، مدلسازی ریاضی ، cancer ، سرطان
کارگاه مدل‌سازی ریاضی در مطالعات زیست‌مولکولی، جایی که ریاضیات به کشف رازهای سرطان کمک می‌کند.
نگاهی کوتاه به این مسیر علمی و نوآورانه
ادامه مطلب

مدل‌سازی ریاضی و یادگیری ماشین

۱۴ مرداد ۰۴ مطالب آموزشی هوش مصنوعی ، بیوانفورماتیک ، رایا زیست آزما ، ریاضی ، ماشین لرنینگ ، AI ، RayaZistAzma ، bioinformatics ، mathematics ، یادگیری ماشین ، آمار
مدل‌سازی ریاضی و یادگیری ماشین
مدل‌سازی ریاضی یعنی استفاده از زبان ریاضی برای توصیف یه مسئله یا سیستم. مثل یه نقشه که مسیر حرکت رو به ما نشون می‌ده!   حالا تو یادگیری ماشین، مدل‌سازی ریاضی کلی کار مهم انجام می‌ده:       کمک می‌کنه مسئله رو دقیق و واضح تعریف کنیم مدل‌های مختلف مثل رگرسیون خطی یا شبکه‌های عصبی رو به صورت فرمول‌های ریاضی بسازیم پارامترهای مدل رو با داده‌ها بهینه کنیم تا …
ادامه مطلب

ارتباط مدلسازی ریاضی با زیست‌شناسی سامانه‌ای چیست؟

۱۲ مرداد ۰۴ مطالب آموزشی بیوانفورماتیک ، رایا زیست آزما ، زیست شناسی محاسباتی ، ریاضی ، bioinformatics ، computational biology ، mathematics ، مدلسازی ریاضی
ارتباط مدلسازی ریاضی با زیست‌شناسی سامانه‌ای چیست؟
زیست‌شناسی سامانه‌ای (Systems Biology) رویکردی نوین برای درک رفتار کل‌نگر سیستم‌های زیستی است. در این رویکرد، به‌جای بررسی یک مولکول یا مسیر خاص به‌تنهایی، به تحلیل تعاملات شبکه‌ای ژن‌ها، پروتئین‌ها و سایر اجزای زیستی پرداخته می‌شود.     در این میان، مدلسازی ریاضی نقش کلیدی دارد. چرا؟ چون به ما امکان می‌دهد این سیستم‌های پیچیده را به زبان ریاضی بیان کنیم، رفتار آن‌ها را در زمان تحلیل کنیم، و حتی …
ادامه مطلب

جستجو در مقالات

سبد خرید