همون‌طور که ما آدما شناسنامه داریم (اسم، سن، قد و …)، داروها هم می‌تونن یک شناسنامه عددی داشته باشن.     این شناسنامه در علم به اسم ماتریس ویژگی داروها (Feature Matrix) شناخته می‌شه. مثلاً: دارو A → وزن مولکولی 300، محلول در آب، ۲ پیوند هیدروژنی دارو B → وزن مولکولی 450، چربی‌دوست، ۵ پیوند هیدروژنی وقتی صدها یا هزاران دارو رو کنار هم بذاریم، یک جدول بزرگ تشکیل …

ادامه مطلب

هر دارو یا مولکول یک ساختار پیچیده شیمیایی دارد، اما برای اینکه رایانه‌ها بتوانند آن را تحلیل کنند، باید این ساختار به زبان اعداد ترجمه شود. اینجاست که ماتریس ویژگی داروها (Feature Matrix) وارد عمل می‌شود.     در این ماتریس، هر دارو به صورت یک ردیف و هر ویژگی (Feature) به صورت یک ستون نمایش داده می‌شود: ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی: وزن مولکولی، LogP، بار الکتریکی… ویژگی‌های ساختاری: تعداد حلقه‌های آروماتیک، …

ادامه مطلب

شاید وقتی اسم ماتریس میاد یاد کلاس ریاضی بیفتید، اما همین ماتریس‌ها قلب تپنده خیلی از پیشرفت‌های امروزی در طراحی دارو هستن. ماتریس‌ها به ما اجازه می‌دن: خواص شیمیایی هزاران مولکول رو در یک جدول منظم ذخیره کنیم. برهم‌کنش داروها با پروتئین‌ها رو در قالب یک Drug–Target Matrix نشون بدیم. شبکه‌های زیستی مثل ارتباط ژن‌ها و پروتئین‌ها رو مدل کنیم. حرکت هزاران اتم رو در شبیه‌سازی دینامیک مولکولی دنبال کنیم. …

ادامه مطلب