چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟

 چرا یه زیست‌شناس باید گراف بلد باشه؟
وقتی اسم گراف میاد، خیلی‌ها یاد یک مفهوم در علم ریاضی می‌افتن!  اما واقعیت اینه که دنیای زیست‌شناسی پر از شبکه‌هاست، و گراف بهترین زبون برای خوندن این شبکه‌هاست.     گراف یعنی مجموعه‌ای از نقطه‌ها (راس‌ها) و خط‌ها (یال‌ها) که نشون می‌ده کی به کی وصله. حالا بذار ببینیم تو زیست چه جوریه: شبکه پروتئین‌ها (PPI): پروتئین‌ها تنها کار نمی‌کنن؛ دست به دست هم می‌دن. هر پروتئین یه راسه …
ادامه مطلب

ماتریس‌ها؛ زبان پنهان طراحی دارو

ماتریس‌ها؛ زبان پنهان طراحی دارو
شاید وقتی اسم ماتریس میاد یاد کلاس ریاضی بیفتید، اما همین ماتریس‌ها قلب تپنده خیلی از پیشرفت‌های امروزی در طراحی دارو هستن. ماتریس‌ها به ما اجازه می‌دن: خواص شیمیایی هزاران مولکول رو در یک جدول منظم ذخیره کنیم. برهم‌کنش داروها با پروتئین‌ها رو در قالب یک Drug–Target Matrix نشون بدیم. شبکه‌های زیستی مثل ارتباط ژن‌ها و پروتئین‌ها رو مدل کنیم. حرکت هزاران اتم رو در شبیه‌سازی دینامیک مولکولی دنبال کنیم. …
ادامه مطلب

چرا مدل‌سازی ریاضی برای زیست‌شناسان ضروری است؟

چرا مدل‌سازی ریاضی برای زیست‌شناسان ضروری است؟
زیست‌شناسی مدرن دیگر فقط توصیف موجودات زنده نیست؛ امروز این علم تحلیلی، کمی و پیش‌بینی‌گر شده است. مدل‌سازی ریاضی به زیست‌شناسان کمک می‌کند:     درک بهتر پدیده‌های پیچیده با مدل‌ها می‌توان فهمید تغییر یک عامل (مثل غلظت آنزیم) چگونه کل سیستم را تغییر می‌دهد. مثال: پیش‌بینی اثر مهار یک پروتئین در توقف رشد تومور.   پیش‌بینی بدون آزمایش پرهزینه یا غیرممکن مدل‌ها می‌توانند سناریوهای مختلف را شبیه‌سازی کنند. مثال: …
ادامه مطلب

مدل‌های ریاضی در یادگیری ماشین

مدل‌های ریاضی در یادگیری ماشین
حالا که فهمیدیم مدل‌سازی ریاضی چقدر مهمه، بیاید چند مدل معروف و ساده رو با هم مرور کنیم:   رگرسیون خطی (Linear Regression) یه مدل خیلی ساده که رابطه‌ی بین ورودی‌ها و خروجی‌ها رو با یه خط یا صفحه توصیف می‌کنه. درخت تصمیم (Decision Tree) یه مدل شبیه یک نمودار شاخه‌دار که سوال‌های ساده می‌پرسه و بر اساس جواب‌ها مسیر رو انتخاب می‌کنه تا به نتیجه برسه. ماشین بردار پشتیبان …
ادامه مطلب

کارگاه مدل‌سازی ریاضی در مطالعات زیست‌مولکولی، جایی که ریاضیات به کشف رازهای سرطان کمک می‌کند.

کارگاه مدل‌سازی ریاضی در مطالعات زیست‌مولکولی، جایی که ریاضیات به کشف رازهای سرطان کمک می‌کند.
نگاهی کوتاه به این مسیر علمی و نوآورانه
ادامه مطلب

ارتباط مدلسازی ریاضی با زیست‌شناسی سامانه‌ای چیست؟

ارتباط مدلسازی ریاضی با زیست‌شناسی سامانه‌ای چیست؟
زیست‌شناسی سامانه‌ای (Systems Biology) رویکردی نوین برای درک رفتار کل‌نگر سیستم‌های زیستی است. در این رویکرد، به‌جای بررسی یک مولکول یا مسیر خاص به‌تنهایی، به تحلیل تعاملات شبکه‌ای ژن‌ها، پروتئین‌ها و سایر اجزای زیستی پرداخته می‌شود.     در این میان، مدلسازی ریاضی نقش کلیدی دارد. چرا؟ چون به ما امکان می‌دهد این سیستم‌های پیچیده را به زبان ریاضی بیان کنیم، رفتار آن‌ها را در زمان تحلیل کنیم، و حتی …
ادامه مطلب

جستجو در مقالات

سبد خرید